ACOPLAMENTO MOLECULAR DE EPSPS COM GLIFOSATO POR MEIO DO USO DO DOCKTHOR

Resumo

O acoplamento molecular é um método que prediz a melhor orientação de uma molécula com relação a um ligante para a formação de um complexo estável. Sendo um dos métodos mais utilizados no design de fármacos baseados em estrutura, é uma ferramenta poderosa com aplicações diversas, ainda pouco utilizada para entender polimorfismos úteis para o melhoramento genético de plantas e para estudos de alterações em populações naturais de plantas. O glifosato é um dos mais importantes herbicidas do mundo, possibilitando o controle efetivo de diversas espécies de plantas daninhas. A crescente adoção de culturas transgênicas resistentes ao glifosato nas Américas causou o aumento do uso deste químico, para o controle em grandes áreas. O entendimento do desenvolvimento da resistência a este herbicida por diferentes plantas é de grande interesse ecológico e agrícola, tendo sido foco de diferentes estudos que já demonstraram de que forma ocorre a ligação da molécula herbicida com a enzima por ela inibida. Dessa forma, esse trabalho teve como objetivo mensurar a capacidade de uso da técnica de acoplamento molecular para predição da orientação de acoplamento entre ligante e receptor para usá-lo posteriormente em estudos de estrutura genética de populações de plantas naturais. Realizou-se o acoplamento entre sequências disponíveis para enzima 5-enolpiruvilchiquimato-3-fosfato-sintase e a estrutura do herbicida em questão, utilizando acoplamento cego através da ferramenta brasileira Dockthor. Os resultados do acoplamento comparados com o de estudo de cristalografia mostra que a técnica de predição pode ser bastante útil e eficiente para encontrar sítios de especial interesse de estudo para as áreas de genética
e ecologia.